モナコに自家用車で行ったことがある方にお聞きしますが、経由国を選択する際にモナコの通過が許可されていないと表示されます ?

それなら行けませんね。実際、モナコでは車を使わない方が良いです。一つは駐車料金が高いこと、もう一つは現地では基本的に徒歩で移動するからです。