9月末の朝にホプンを出発して、東部のフィヨルドを経由してミーヴァトンに泊まる。このルートは現実的ですか ?

大雪が降らなければ、特に問題はないと思います。

9月末にはパフィンはいないはずです。ホプンからミーヴァトンまでの移動も可能です。初めて行ったのは10月初めで、だいたい6時頃に暗くなりました。

可能ですが、少し疲れるかもしれません。私は途中で宿泊しましたが、ホプンから出発しました。

可能です。ただし、丸一日移動が必要です。翌日にミーヴァトン周辺の観光を楽しむことができます。