チェコで直接現金を引き出すのがお得ですか、それともユーロを両替してからの方が良いですか ?

直接引き出すのが一番お得です。

ドルやユーロを現地でチェココルナに両替する方が比較的お得です。具体的にドルかユーロのどちらを使うかは、その時の為替レートによります。プラハ市内の両替店のレートが良い場合もあるので、いくつかのお店を見比べるのがおすすめです。