レンタカーの保証金がプレオーソリゼーションではなく、直接消費として引き落とされた場合問題がありますか ?

返却時に返金されます。

問題ありません。たとえ消費として扱われても、直接引き落とされるわけではなく、キャンセルされるまで凍結されたままです。

返却後、数日でクレジットカードに返金されます。ローマのeuropcarでそのような操作をされました。